复旦大学学术规范委员会对此事件进行了全面的调查。经查，信中涉及的“造假、剽窃”文章的第一作者是L，于2004年9月至2006年7月期间在复旦大学五官科医院做博士后，该文章的通讯作者正是C，当时是刘的博士后工作指导教师。
L承认，被举报文章的设计和实验是他在郑州读博士生期间的部分工作，到五官科医院做博士后以后，为了便于将这部分工作作为成果发表，他窃用了他人的部分图片来说明观点，文章的其他作者（包括C教授）对其剽窃行为并不知道。
2007年9月5日，五官科医院学术委员会研究对该事件的处理。与会委员认为，该论文的抄袭是L个人行为，但C教授负有把关不严的责任；会上，C做了检讨。
9月14日，医院学术委员会作出对此事件的处理意见：1．此篇论文属抄袭；2．取消并收回L博士后出站证书；3．C教授停止招收博士后两年；4．在一定范围内通报批评、导师C教授检讨；5．各科室予以传达、重申纪律，加强科研道德教育。
9月30日，复旦大学学术规范委员会全体会议对此事件进行了审议，同意医院学术委员会对此事件的调查结论和处理意见，并建议在全校博士后流动站会议上对L论文抄袭行为进行通报。
信息学院副院长因弟子抄袭被暂停招生资格
第三起学术违规事件同样来自“新语丝”的网络举报。
2007年8月14日，新语丝网站出现举报复旦大学信息学院Y、G两篇论文涉嫌抄袭的帖子；不久，复旦大学又收到信息学院退休教师发来的实名举报信件，称Y的两篇论文“An Approach for Robust Distributed Data Retrieval in Data Intensive Grid Environments”（2006 1st International Symposium on Pervasive Computing and A pplications，pp194 -199，以下称为论文A）和“在数据网格环境中可靠获取分布式数据的方法”（《通信学报》，27 （11），119-124，2006，以下称为论文B）的内容基本相同。
同时，论文A、B部分内容涉嫌抄袭论文C：“Kavitha Ranganathan，Adriana Iaminitchi and Ian Foster，Proceedings of the 2nd IEEE ／ACM International Symposium on Cluster Computing and theGrid，2002”，即论文A中的参考文献标号［4］。
接到举报后，复旦大学学术规范委员会责成信息学院组成学术规范小组，负责调查此事。学院学术规范小组经过对论文A、B与论文C的内容的细致比对，认为举报情况属实，论文A和B具有严重抄袭行为。
Y是G的博士生，他承认这两篇论文是其本人独立向ISPCA国际会议和通讯学报投稿的论文，G知道其投稿并表示同意，但Y在投稿时忘记将投稿论文同时传给G。
当论文涉嫌抄袭一事被举报后，论文作者均意识到自己错误的严重性，立即用电子邮件向论文C的作者进行道歉，向登载论文B和C的刊物作了说明和道歉，并在校内多次做了书面检查。
2007年9月30日、10月31日和12月3日，复旦大学学术规范委员会举行三次全体会议，就Y、G的两篇论文涉嫌抄袭一事进行审议。委员会认为举报情况属实，Y、G的两篇论文具有严重抄袭行为。Y作为主要责任人，对其作出开除研究生学籍的处理；建议研究生院暂停G教授两年内招收研究生资格；并建议学校同意G教授辞去信息学院副院长职务的请求。
值得注意的是，G也是信息学院学术委员会的副主任。
尽管学生对处罚轻重评价不一 但普遍认为处罚了就是进步
复旦大学学术规范委员会发布“1号通告”以后，在校园BBS上引起了热议，不少同学表示“引以为戒”，“此举对于掠美他人成果者，无疑是一次警示”，“我想那些博导更要引以为戒，自己也要对所在领域进展很熟，看PAPER（论文）很多才行”。
